Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTBP49356 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTBP49356 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTBP49356 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTBP49356 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTBP49356 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTBP49356 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTBP49356 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTBP49356 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTBP49356 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTBP49356 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTBP49356 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTBP49356 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTBP49356 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTBP49356 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTBP49356 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTBP49356 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTBP49356 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTBP49356 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTBP49356 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTBP49356 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTBP49356 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTBP49356 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTBP49356 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTBP49356 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTBP49356 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTBP49356 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTBP49356 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTBP49356 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTBP49356 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FNTBP49356 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNTBP49356 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNTBP49356 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTBP49356 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTBP49356 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTBP49356 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTBP49356 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTBP49356 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTBP49356 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTBP49356 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTBP49356 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTBP49356 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTBP49356 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTBP49356 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTBP49356 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTBP49356 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTBP49356 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTBP49356 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTBP49356 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTBP49356 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTBP49356 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTBP49356 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTBP49356 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTBP49356 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTBP49356 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTBP49356 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTBP49356 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTBP49356 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTBP49356 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTBP49356 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTBP49356 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTBP49356 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTBP49356 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTBP49356 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTBP49356 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTBP49356 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTBP49356 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTBP49356 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTBP49356 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTBP49356 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FNTBP49356 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTBP49356 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTBP49356 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTBP49356 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTBP49356 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTBP49356 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTBP49356 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTBP49356 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTBP49356 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTBP49356 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTBP49356 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTBP49356 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTBP49356 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTBP49356 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTBP49356 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTBP49356 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTBP49356 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTBP49356 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms