Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSL1P49006 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSL1P49006 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARCKSL1P49006 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms