Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGER3P43115 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms