Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4KAP42356 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PI4KAP42356 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PI4KAP42356 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms