Protein–RNA interactions for Protein: P40318

SSM4, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase DOA10, yeastyeast

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Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSM4P40318 SMF3YLR034C 1422 nt7.57□□□□□ -1.2
SSM4P40318 HSM3YBR272C 1443 nt7.57□□□□□ -1.2
SSM4P40318 YHC3YJL059W 1227 nt7.56□□□□□ -1.2
SSM4P40318 PRP45YAL032C 1140 nt7.56□□□□□ -1.2
SSM4P40318 DCC1YCL016C 1143 nt7.56□□□□□ -1.2
SSM4P40318 RAT1YOR048C 3021 nt7.56□□□□□ -1.2
SSM4P40318 THI4YGR144W 981 nt7.55□□□□□ -1.2
SSM4P40318 TBF1YPL128C 1689 nt7.54□□□□□ -1.2
SSM4P40318 HEM3YDL205C 984 nt7.54□□□□□ -1.2
SSM4P40318 POM33YLL023C 840 nt7.54□□□□□ -1.2
SSM4P40318 ALD6YPL061W 1503 nt7.54□□□□□ -1.2
SSM4P40318 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt7.53□□□□□ -1.2
SSM4P40318 MRPL15YLR312W-A 762 nt7.53□□□□□ -1.2
SSM4P40318 VMA13YPR036W 1437 nt7.53□□□□□ -1.2
SSM4P40318 HPF1YOL155C 2904 nt7.53□□□□□ -1.2
SSM4P40318 GLO2YDR272W 825 nt7.52□□□□□ -1.2
SSM4P40318 SEH1YGL100W 1050 nt7.52□□□□□ -1.2
SSM4P40318 YGR139WYGR139W 339 nt7.52□□□□□ -1.2
SSM4P40318 ATG20YDL113C 1923 nt7.52□□□□□ -1.21
SSM4P40318 TPK1YJL164C 1194 nt7.52□□□□□ -1.21
SSM4P40318 LEM3YNL323W 1245 nt7.52□□□□□ -1.21
SSM4P40318 PDR18YNR070W 4002 nt7.51□□□□□ -1.21
SSM4P40318 GAL10YBR019C 2100 nt7.51□□□□□ -1.21
SSM4P40318 CIT3YPR001W 1461 nt7.51□□□□□ -1.21
SSM4P40318 YFL034WYFL034W 3222 nt7.51□□□□□ -1.21
SSM4P40318 CDC43YGL155W 1131 nt7.51□□□□□ -1.21
SSM4P40318 BGL2YGR282C 942 nt7.51□□□□□ -1.21
SSM4P40318 YNL165WYNL165W 1221 nt7.51□□□□□ -1.21
SSM4P40318 ERI1YPL096C-A 207 nt7.51□□□□□ -1.21
SSM4P40318 HSP26YBR072W 645 nt7.51□□□□□ -1.21
SSM4P40318 BUD9YGR041W 1644 nt7.5□□□□□ -1.21
SSM4P40318 EPS1YIL005W 2106 nt7.5□□□□□ -1.21
SSM4P40318 RPS19BYNL302C 435 nt7.5□□□□□ -1.21
SSM4P40318 SAC6YDR129C 1929 nt7.5□□□□□ -1.21
SSM4P40318 ACS1YAL054C 2142 nt7.49□□□□□ -1.21
SSM4P40318 CLP1YOR250C 1338 nt7.49□□□□□ -1.21
SSM4P40318 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt7.49□□□□□ -1.21
SSM4P40318 PNP1YLR209C 936 nt7.49□□□□□ -1.21
SSM4P40318 HOR7YMR251W-A 180 nt7.49□□□□□ -1.21
SSM4P40318 GPM3YOL056W 912 nt7.49□□□□□ -1.21
SSM4P40318 LAG2YOL025W 1983 nt7.49□□□□□ -1.21
SSM4P40318 SFB3YHR098C 2790 nt7.49□□□□□ -1.21
SSM4P40318 YAP1YML007W 1953 nt7.48□□□□□ -1.21
SSM4P40318 YPT32YGL210W 669 nt7.48□□□□□ -1.21
SSM4P40318 BUD28YLR062C 378 nt7.48□□□□□ -1.21
SSM4P40318 SCO1YBR037C 888 nt7.48□□□□□ -1.21
SSM4P40318 RFA1YAR007C 1866 nt7.47□□□□□ -1.21
SSM4P40318 KIP2YPL155C 2121 nt7.47□□□□□ -1.21
SSM4P40318 APJ1YNL077W 1587 nt7.47□□□□□ -1.21
SSM4P40318 GCS1YDL226C 1059 nt7.47□□□□□ -1.21
SSM4P40318 YDR053WYDR053W 396 nt7.47□□□□□ -1.21
SSM4P40318 MNN10YDR245W 1182 nt7.47□□□□□ -1.21
SSM4P40318 UTR4YEL038W 684 nt7.47□□□□□ -1.21
SSM4P40318 RPN12YFR052W 825 nt7.47□□□□□ -1.21
SSM4P40318 YML101C-AYML101C-A 318 nt7.46□□□□□ -1.22
SSM4P40318 YMR027WYMR027W 1413 nt7.46□□□□□ -1.22
SSM4P40318 GSY2YLR258W 2118 nt7.45□□□□□ -1.22
SSM4P40318 SNU71YGR013W 1863 nt7.45□□□□□ -1.22
SSM4P40318 BRF1YGR246C 1791 nt7.45□□□□□ -1.22
SSM4P40318 LCP5YER127W 1074 nt7.45□□□□□ -1.22
SSM4P40318 ATG17YLR423C 1254 nt7.45□□□□□ -1.22
SSM4P40318 FOL1YNL256W 2475 nt7.45□□□□□ -1.22
SSM4P40318 TNA1YGR260W 1605 nt7.44□□□□□ -1.22
SSM4P40318 HXT2YMR011W 1626 nt7.44□□□□□ -1.22
SSM4P40318 AVT3YKL146W 2079 nt7.44□□□□□ -1.22
SSM4P40318 EFT2YDR385W 2529 nt7.44□□□□□ -1.22
SSM4P40318 EFT1YOR133W 2529 nt7.44□□□□□ -1.22
SSM4P40318 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt7.44□□□□□ -1.22
SSM4P40318 YNL019CYNL019C 855 nt7.44□□□□□ -1.22
SSM4P40318 YNL033WYNL033W 855 nt7.44□□□□□ -1.22
SSM4P40318 IES1YFL013C 2079 nt7.44□□□□□ -1.22
SSM4P40318 JEM1YJL073W 1938 nt7.44□□□□□ -1.22
SSM4P40318 YOR024WYOR024W 324 nt7.43□□□□□ -1.22
SSM4P40318 YBR284WYBR284W 2394 nt7.43□□□□□ -1.22
SSM4P40318 RPT4YOR259C 1314 nt7.43□□□□□ -1.22
SSM4P40318 ADE4YMR300C 1533 nt7.42□□□□□ -1.22
SSM4P40318 ECM3YOR092W 1842 nt7.42□□□□□ -1.22
SSM4P40318 REC114YMR133W 1287 nt7.41□□□□□ -1.22
SSM4P40318 PRR1YKL116C 1557 nt7.41□□□□□ -1.22
SSM4P40318 RIM101YHL027W 1878 nt7.4□□□□□ -1.22
SSM4P40318 FET3YMR058W 1911 nt7.39□□□□□ -1.23
SSM4P40318 MSH1YHR120W 2880 nt7.39□□□□□ -1.23
SSM4P40318 CTS1YLR286C 1689 nt7.39□□□□□ -1.23
SSM4P40318 VCX1YDL128W 1236 nt7.39□□□□□ -1.23
SSM4P40318 SHO1YER118C 1104 nt7.39□□□□□ -1.23
SSM4P40318 YKL223WYKL223W 333 nt7.39□□□□□ -1.23
SSM4P40318 PRE7YBL041W 726 nt7.39□□□□□ -1.23
SSM4P40318 HAL5YJL165C 2568 nt7.39□□□□□ -1.23
SSM4P40318 DAK1YML070W 1755 nt7.39□□□□□ -1.23
SSM4P40318 TRP3YKL211C 1455 nt7.39□□□□□ -1.23
SSM4P40318 PDC1YLR044C 1692 nt7.38□□□□□ -1.23
SSM4P40318 SKN1YGR143W 2316 nt7.38□□□□□ -1.23
SSM4P40318 FAU1YER183C 636 nt7.38□□□□□ -1.23
SSM4P40318 KTI12YKL110C 942 nt7.38□□□□□ -1.23
SSM4P40318 SPG4YMR107W 348 nt7.38□□□□□ -1.23
SSM4P40318 SKI2YLR398C 3864 nt7.38□□□□□ -1.23
SSM4P40318 SSZ1YHR064C 1617 nt7.38□□□□□ -1.23
SSM4P40318 VPS70YJR126C 2436 nt7.37□□□□□ -1.23
SSM4P40318 MTW1YAL034W-A 870 nt7.37□□□□□ -1.23
SSM4P40318 POR1YNL055C 852 nt7.37□□□□□ -1.23
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