Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FDFT1P37268 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FDFT1P37268 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FDFT1P37268 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms