Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2IP36954 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms