Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBRP36941 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBRP36941 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBRP36941 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBRP36941 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBRP36941 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBRP36941 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBRP36941 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBRP36941 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBRP36941 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBRP36941 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBRP36941 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBRP36941 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBRP36941 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBRP36941 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBRP36941 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBRP36941 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBRP36941 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBRP36941 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBRP36941 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBRP36941 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBRP36941 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBRP36941 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBRP36941 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBRP36941 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBRP36941 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBRP36941 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBRP36941 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBRP36941 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBRP36941 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBRP36941 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBRP36941 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBRP36941 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBRP36941 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBRP36941 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBRP36941 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBRP36941 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBRP36941 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBRP36941 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBRP36941 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBRP36941 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBRP36941 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LTBRP36941 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBRP36941 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBRP36941 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBRP36941 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBRP36941 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBRP36941 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBRP36941 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBRP36941 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBRP36941 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBRP36941 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBRP36941 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBRP36941 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBRP36941 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBRP36941 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBRP36941 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBRP36941 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBRP36941 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBRP36941 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBRP36941 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBRP36941 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBRP36941 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBRP36941 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBRP36941 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBRP36941 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBRP36941 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTBRP36941 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBRP36941 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBRP36941 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBRP36941 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBRP36941 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBRP36941 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBRP36941 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBRP36941 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBRP36941 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBRP36941 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBRP36941 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTBRP36941 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBRP36941 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBRP36941 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBRP36941 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBRP36941 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBRP36941 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBRP36941 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBRP36941 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBRP36941 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBRP36941 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBRP36941 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBRP36941 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms