Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGFBR1P36897 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms