Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX5P35711 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX5P35711 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX5P35711 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX5P35711 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX5P35711 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX5P35711 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX5P35711 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX5P35711 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX5P35711 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX5P35711 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX5P35711 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX5P35711 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX5P35711 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX5P35711 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX5P35711 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX5P35711 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX5P35711 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX5P35711 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX5P35711 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX5P35711 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX5P35711 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX5P35711 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX5P35711 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX5P35711 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX5P35711 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX5P35711 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX5P35711 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX5P35711 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX5P35711 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX5P35711 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX5P35711 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX5P35711 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX5P35711 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX5P35711 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX5P35711 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX5P35711 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX5P35711 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX5P35711 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX5P35711 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX5P35711 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX5P35711 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX5P35711 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX5P35711 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX5P35711 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX5P35711 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX5P35711 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX5P35711 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX5P35711 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX5P35711 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX5P35711 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX5P35711 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX5P35711 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX5P35711 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX5P35711 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX5P35711 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX5P35711 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX5P35711 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX5P35711 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX5P35711 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX5P35711 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX5P35711 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX5P35711 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX5P35711 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX5P35711 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX5P35711 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX5P35711 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX5P35711 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX5P35711 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX5P35711 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX5P35711 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX5P35711 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX5P35711 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX5P35711 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX5P35711 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX5P35711 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX5P35711 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX5P35711 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX5P35711 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX5P35711 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX5P35711 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX5P35711 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX5P35711 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX5P35711 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX5P35711 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX5P35711 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX5P35711 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX5P35711 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX5P35711 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX5P35711 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms