Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
THBS4P35443 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
THBS4P35443 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
THBS4P35443 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
THBS4P35443 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
THBS4P35443 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
THBS4P35443 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
THBS4P35443 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
THBS4P35443 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
THBS4P35443 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
THBS4P35443 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
THBS4P35443 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
THBS4P35443 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
THBS4P35443 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
THBS4P35443 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
THBS4P35443 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
THBS4P35443 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
THBS4P35443 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
THBS4P35443 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
THBS4P35443 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
THBS4P35443 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
THBS4P35443 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
THBS4P35443 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
THBS4P35443 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
THBS4P35443 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
THBS4P35443 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
THBS4P35443 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
THBS4P35443 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
THBS4P35443 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
THBS4P35443 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
THBS4P35443 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
THBS4P35443 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
THBS4P35443 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
THBS4P35443 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
THBS4P35443 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
THBS4P35443 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
THBS4P35443 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
THBS4P35443 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
THBS4P35443 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
THBS4P35443 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
THBS4P35443 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
THBS4P35443 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
THBS4P35443 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
THBS4P35443 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
THBS4P35443 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
THBS4P35443 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
THBS4P35443 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
THBS4P35443 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
THBS4P35443 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
THBS4P35443 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
THBS4P35443 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
THBS4P35443 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
THBS4P35443 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
THBS4P35443 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
THBS4P35443 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
THBS4P35443 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
THBS4P35443 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
THBS4P35443 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
THBS4P35443 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
THBS4P35443 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
THBS4P35443 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
THBS4P35443 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
THBS4P35443 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
THBS4P35443 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
THBS4P35443 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
THBS4P35443 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
THBS4P35443 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
THBS4P35443 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
THBS4P35443 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
THBS4P35443 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
THBS4P35443 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
THBS4P35443 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
THBS4P35443 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THBS4P35443 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
THBS4P35443 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THBS4P35443 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
THBS4P35443 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THBS4P35443 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
THBS4P35443 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms