Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM4P33991 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM4P33991 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM4P33991 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM4P33991 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM4P33991 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM4P33991 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM4P33991 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM4P33991 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM4P33991 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCM4P33991 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM4P33991 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM4P33991 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM4P33991 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM4P33991 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM4P33991 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM4P33991 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM4P33991 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM4P33991 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM4P33991 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM4P33991 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM4P33991 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM4P33991 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCM4P33991 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MCM4P33991 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM4P33991 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM4P33991 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM4P33991 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCM4P33991 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MCM4P33991 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MCM4P33991 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MCM4P33991 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MCM4P33991 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MCM4P33991 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM4P33991 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM4P33991 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MCM4P33991 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM4P33991 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCM4P33991 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCM4P33991 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCM4P33991 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCM4P33991 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCM4P33991 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCM4P33991 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MCM4P33991 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM4P33991 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MCM4P33991 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM4P33991 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MCM4P33991 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM4P33991 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MCM4P33991 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM4P33991 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM4P33991 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM4P33991 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM4P33991 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM4P33991 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM4P33991 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MCM4P33991 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM4P33991 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM4P33991 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM4P33991 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM4P33991 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM4P33991 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM4P33991 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM4P33991 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM4P33991 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM4P33991 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM4P33991 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM4P33991 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM4P33991 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM4P33991 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM4P33991 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM4P33991 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM4P33991 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM4P33991 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM4P33991 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCM4P33991 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCM4P33991 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCM4P33991 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms