Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL9P32969 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL9P32969 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL9P32969 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL9P32969 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL9P32969 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL9P32969 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL9P32969 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL9P32969 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL9P32969 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL9P32969 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL9P32969 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL9P32969 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL9P32969 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL9P32969 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL9P32969 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL9P32969 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL9P32969 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL9P32969 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL9P32969 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL9P32969 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL9P32969 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL9P32969 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL9P32969 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL9P32969 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL9P32969 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPL9P32969 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL9P32969 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL9P32969 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL9P32969 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL9P32969 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL9P32969 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL9P32969 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL9P32969 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL9P32969 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL9P32969 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL9P32969 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL9P32969 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL9P32969 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL9P32969 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL9P32969 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL9P32969 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL9P32969 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL9P32969 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL9P32969 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL9P32969 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL9P32969 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL9P32969 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL9P32969 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL9P32969 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL9P32969 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL9P32969 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL9P32969 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL9P32969 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL9P32969 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL9P32969 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL9P32969 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL9P32969 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL9P32969 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL9P32969 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL9P32969 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL9P32969 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL9P32969 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL9P32969 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL9P32969 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL9P32969 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL9P32969 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL9P32969 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL9P32969 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL9P32969 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL9P32969 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL9P32969 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL9P32969 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL9P32969 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL9P32969 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL9P32969 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL9P32969 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL9P32969 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL9P32969 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL9P32969 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL9P32969 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL9P32969 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL9P32969 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL9P32969 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL9P32969 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL9P32969 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL9P32969 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL9P32969 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL9P32969 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL9P32969 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms