Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DSG3P32926 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DSG3P32926 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSG3P32926 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSG3P32926 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSG3P32926 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSG3P32926 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSG3P32926 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSG3P32926 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSG3P32926 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSG3P32926 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG3P32926 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG3P32926 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG3P32926 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG3P32926 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG3P32926 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG3P32926 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG3P32926 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DSG3P32926 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DSG3P32926 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DSG3P32926 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DSG3P32926 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DSG3P32926 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG3P32926 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG3P32926 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG3P32926 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG3P32926 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG3P32926 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG3P32926 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG3P32926 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG3P32926 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG3P32926 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSG3P32926 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSG3P32926 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSG3P32926 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSG3P32926 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSG3P32926 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSG3P32926 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG3P32926 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG3P32926 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG3P32926 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG3P32926 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG3P32926 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG3P32926 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG3P32926 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG3P32926 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG3P32926 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSG3P32926 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSG3P32926 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DSG3P32926 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DSG3P32926 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG3P32926 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG3P32926 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG3P32926 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG3P32926 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG3P32926 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG3P32926 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG3P32926 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG3P32926 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG3P32926 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSG3P32926 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSG3P32926 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DSG3P32926 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSG3P32926 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSG3P32926 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSG3P32926 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSG3P32926 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG3P32926 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG3P32926 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG3P32926 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG3P32926 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG3P32926 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG3P32926 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG3P32926 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG3P32926 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG3P32926 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG3P32926 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG3P32926 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG3P32926 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG3P32926 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG3P32926 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG3P32926 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG3P32926 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG3P32926 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG3P32926 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG3P32926 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG3P32926 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG3P32926 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG3P32926 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG3P32926 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DSG3P32926 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DSG3P32926 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DSG3P32926 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DSG3P32926 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DSG3P32926 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DSG3P32926 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DSG3P32926 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DSG3P32926 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DSG3P32926 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG3P32926 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms