Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP1P32455 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP1P32455 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP1P32455 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP1P32455 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP1P32455 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP1P32455 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP1P32455 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP1P32455 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP1P32455 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP1P32455 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP1P32455 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP1P32455 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP1P32455 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP1P32455 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP1P32455 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP1P32455 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP1P32455 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP1P32455 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP1P32455 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP1P32455 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP1P32455 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP1P32455 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP1P32455 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP1P32455 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP1P32455 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP1P32455 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP1P32455 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP1P32455 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP1P32455 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP1P32455 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP1P32455 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP1P32455 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP1P32455 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP1P32455 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP1P32455 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP1P32455 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP1P32455 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP1P32455 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP1P32455 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP1P32455 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP1P32455 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP1P32455 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP1P32455 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP1P32455 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP1P32455 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP1P32455 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP1P32455 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP1P32455 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP1P32455 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP1P32455 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP1P32455 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP1P32455 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP1P32455 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GBP1P32455 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP1P32455 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP1P32455 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP1P32455 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP1P32455 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP1P32455 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP1P32455 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP1P32455 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP1P32455 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP1P32455 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP1P32455 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms