Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCKARP32238 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCKARP32238 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCKARP32238 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCKARP32238 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCKARP32238 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCKARP32238 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCKARP32238 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCKARP32238 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCKARP32238 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCKARP32238 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCKARP32238 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCKARP32238 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCKARP32238 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCKARP32238 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCKARP32238 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCKARP32238 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCKARP32238 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCKARP32238 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCKARP32238 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCKARP32238 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCKARP32238 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCKARP32238 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCKARP32238 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCKARP32238 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCKARP32238 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCKARP32238 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCKARP32238 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCKARP32238 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCKARP32238 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCKARP32238 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCKARP32238 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCKARP32238 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCKARP32238 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCKARP32238 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCKARP32238 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCKARP32238 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCKARP32238 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCKARP32238 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCKARP32238 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCKARP32238 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCKARP32238 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCKARP32238 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCKARP32238 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCKARP32238 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCKARP32238 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCKARP32238 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCKARP32238 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCKARP32238 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCKARP32238 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCKARP32238 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCKARP32238 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCKARP32238 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCKARP32238 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCKARP32238 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCKARP32238 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCKARP32238 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCKARP32238 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCKARP32238 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCKARP32238 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCKARP32238 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCKARP32238 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCKARP32238 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCKARP32238 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCKARP32238 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCKARP32238 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCKARP32238 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCKARP32238 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCKARP32238 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCKARP32238 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCKARP32238 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCKARP32238 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCKARP32238 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCKARP32238 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCKARP32238 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCKARP32238 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCKARP32238 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms