Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC3AP31941 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC3AP31941 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms