Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA5P30532 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA5P30532 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CHRNA5P30532 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNA5P30532 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms