Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTKP29376 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTKP29376 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTKP29376 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTKP29376 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTKP29376 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTKP29376 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTKP29376 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTKP29376 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
LTKP29376 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTKP29376 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTKP29376 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTKP29376 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTKP29376 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTKP29376 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
LTKP29376 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTKP29376 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
LTKP29376 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTKP29376 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTKP29376 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTKP29376 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTKP29376 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTKP29376 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTKP29376 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTKP29376 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LTKP29376 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LTKP29376 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
LTKP29376 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
LTKP29376 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTKP29376 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTKP29376 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTKP29376 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
LTKP29376 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTKP29376 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTKP29376 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LTKP29376 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
LTKP29376 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTKP29376 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTKP29376 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTKP29376 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTKP29376 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTKP29376 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTKP29376 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTKP29376 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTKP29376 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
LTKP29376 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTKP29376 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTKP29376 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTKP29376 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LTKP29376 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
LTKP29376 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LTKP29376 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
LTKP29376 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LTKP29376 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LTKP29376 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
LTKP29376 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LTKP29376 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LTKP29376 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LTKP29376 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LTKP29376 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LTKP29376 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LTKP29376 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LTKP29376 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LTKP29376 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
LTKP29376 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LTKP29376 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LTKP29376 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LTKP29376 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LTKP29376 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LTKP29376 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LTKP29376 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LTKP29376 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LTKP29376 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
LTKP29376 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LTKP29376 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
LTKP29376 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTKP29376 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTKP29376 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LTKP29376 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LTKP29376 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LTKP29376 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTKP29376 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTKP29376 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTKP29376 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTKP29376 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LTKP29376 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTKP29376 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTKP29376 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTKP29376 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LTKP29376 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LTKP29376 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LTKP29376 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LTKP29376 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTKP29376 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTKP29376 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTKP29376 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTKP29376 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LTKP29376 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LTKP29376 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LTKP29376 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms