Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA3P29320 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms