Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD38P28907 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD38P28907 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD38P28907 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD38P28907 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD38P28907 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD38P28907 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD38P28907 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD38P28907 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD38P28907 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD38P28907 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD38P28907 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD38P28907 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD38P28907 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD38P28907 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD38P28907 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD38P28907 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD38P28907 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD38P28907 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD38P28907 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD38P28907 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD38P28907 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD38P28907 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD38P28907 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD38P28907 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD38P28907 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD38P28907 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD38P28907 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD38P28907 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CD38P28907 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD38P28907 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD38P28907 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD38P28907 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CD38P28907 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD38P28907 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD38P28907 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD38P28907 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD38P28907 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD38P28907 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD38P28907 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD38P28907 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD38P28907 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD38P28907 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD38P28907 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD38P28907 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD38P28907 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD38P28907 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD38P28907 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD38P28907 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CD38P28907 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD38P28907 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD38P28907 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD38P28907 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD38P28907 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD38P28907 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD38P28907 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD38P28907 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD38P28907 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD38P28907 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD38P28907 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD38P28907 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD38P28907 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD38P28907 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD38P28907 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD38P28907 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD38P28907 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD38P28907 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD38P28907 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD38P28907 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD38P28907 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD38P28907 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD38P28907 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD38P28907 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD38P28907 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD38P28907 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD38P28907 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD38P28907 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD38P28907 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD38P28907 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD38P28907 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD38P28907 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD38P28907 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD38P28907 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD38P28907 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD38P28907 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD38P28907 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD38P28907 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD38P28907 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD38P28907 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD38P28907 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms