Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL1P28749 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL1P28749 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL1P28749 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL1P28749 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL1P28749 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL1P28749 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL1P28749 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL1P28749 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL1P28749 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL1P28749 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL1P28749 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBL1P28749 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBL1P28749 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBL1P28749 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBL1P28749 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBL1P28749 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBL1P28749 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL1P28749 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL1P28749 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL1P28749 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL1P28749 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBL1P28749 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL1P28749 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL1P28749 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL1P28749 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL1P28749 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL1P28749 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL1P28749 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL1P28749 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBL1P28749 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL1P28749 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL1P28749 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL1P28749 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL1P28749 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL1P28749 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL1P28749 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL1P28749 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL1P28749 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBL1P28749 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL1P28749 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL1P28749 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL1P28749 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL1P28749 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL1P28749 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL1P28749 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL1P28749 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL1P28749 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBL1P28749 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL1P28749 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL1P28749 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL1P28749 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL1P28749 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL1P28749 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL1P28749 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL1P28749 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL1P28749 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RBL1P28749 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBL1P28749 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RBL1P28749 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBL1P28749 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBL1P28749 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBL1P28749 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBL1P28749 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBL1P28749 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBL1P28749 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBL1P28749 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBL1P28749 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBL1P28749 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBL1P28749 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBL1P28749 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBL1P28749 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBL1P28749 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBL1P28749 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBL1P28749 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBL1P28749 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBL1P28749 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBL1P28749 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBL1P28749 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBL1P28749 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBL1P28749 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBL1P28749 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBL1P28749 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBL1P28749 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBL1P28749 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms