Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.871e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.733e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-208ENST00000507915 1165 ntTSL 320.37■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.793e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-210ENST00000508422 477 ntTSL 219.15■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.633e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.623e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-204ENST00000504236 580 ntTSL 318.51■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-215ENST00000513750 2081 ntTSL 217.52■□□□□ 0.43e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-209ENST00000508417 2009 ntTSL 217.18■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ANKRD13D-213ENST00000512231 2768 ntTSL 213.27□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 38.6
DDX6P26196 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 517■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.87□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 38.4
DDX6P26196 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 38.4
DDX6P26196 CCDC88B-204ENST00000463837 5235 ntTSL 218.43■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 38.4
DDX6P26196 CCDC88B-209ENST00000494080 4563 ntTSL 215.74■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 38.4
DDX6P26196 NACC1-203ENST00000586171 534 ntTSL 518.31■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 38.3
DDX6P26196 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-11■■■■■ 38.3
DDX6P26196 RFX7-202ENST00000559847 4165 ntTSL 1 (best)4.07□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 38.3
DDX6P26196 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 38.3
DDX6P26196 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.45e-7■■■■■ 38.3
DDX6P26196 FKBP2-204ENST00000535135 639 ntTSL 326.21■■□□□ 1.794e-8■■■■■ 38
DDX6P26196 FKBP2-205ENST00000536642 637 ntTSL 220.73■□□□□ 0.914e-8■■■■■ 38
DDX6P26196 NXN-209ENST00000575455 914 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 37.8
DDX6P26196 NXN-212ENST00000577098 659 ntTSL 314.16□□□□□ -0.147e-7■■■■■ 37.8
DDX6P26196 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 37.8
DDX6P26196 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.381e-6■■■■■ 37.7
DDX6P26196 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 225.46■■□□□ 1.672e-7■■■■■ 37.7
DDX6P26196 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 225.12■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 37.7
DDX6P26196 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 37.6
DDX6P26196 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 56.66□□□□□ -1.346e-7■■■■■ 37.6
DDX6P26196 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 37.6
DDX6P26196 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.863e-7■■■■■ 37.6
DDX6P26196 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 37.5
DDX6P26196 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 37.5
DDX6P26196 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 ZNF292-207ENST00000496806 770 ntTSL 315.28■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 PPP1R3C-201ENST00000238994 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 ZNF292-205ENST00000466062 838 ntTSL 55.83□□□□□ -1.484e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 DUSP16-206ENST00000545864 554 ntTSL 44.63□□□□□ -1.674e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.062e-10■■■■■ 37.4
DDX6P26196 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 SETD5-202ENST00000399686 3362 ntTSL 56.75□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 37.4
DDX6P26196 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 37.3
DDX6P26196 SLC22A5-204ENST00000437841 850 ntTSL 515.36■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 37.3
DDX6P26196 SLC22A5-202ENST00000415928 720 ntTSL 514.29□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 37.3
DDX6P26196 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 37.3
DDX6P26196 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 37.2
DDX6P26196 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-27■■■■■ 37
DDX6P26196 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 316.96■□□□□ 0.311e-31■■■■■ 37
DDX6P26196 SEMA4C-206ENST00000482925 3776 ntTSL 212.57□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 36.8
DDX6P26196 DKK1-204ENST00000494277 465 ntTSL 54.52□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 36.7
DDX6P26196 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.963e-9■■■■■ 36.7
DDX6P26196 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.853e-9■■■■■ 36.7
DDX6P26196 CADM1-207ENST00000537140 1646 ntTSL 1 (best)22.9■■□□□ 1.264e-6■■■■■ 36.6
DDX6P26196 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.779e-7■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CCDC12-208ENST00000603885 560 ntTSL 319.37■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CCDC12-205ENST00000488069 897 ntTSL 219.37■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CCDC12-212ENST00000605358 402 ntTSL 519.23■□□□□ 0.671e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 MYBBP1A-211ENST00000574547 1607 ntTSL 1 (best)18.5■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 MYBBP1A-205ENST00000571368 1995 ntTSL 218.31■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.419e-7■■■■■ 36.6
DDX6P26196 MYBBP1A-206ENST00000572759 588 ntTSL 317.45■□□□□ 0.381e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CADM1-218ENST00000545380 2373 ntTSL 1 (best)16.88■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 36.6
DDX6P26196 FGFR1-216ENST00000466021 823 ntTSL 216.28■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 36.6
DDX6P26196 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 METTL7A-204ENST00000550097 1846 ntTSL 515.18■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 FGFR1-222ENST00000487647 1608 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -04e-6■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CCDC12-211ENST00000604367 2412 nt14.92□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 MYBBP1A-212ENST00000574934 1941 ntTSL 214.54□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 MYBBP1A-210ENST00000574167 746 ntTSL 314.27□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 METTL7A-202ENST00000547104 1825 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 MYBBP1A-209ENST00000573723 613 ntTSL 513.08□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 36.6
DDX6P26196 MYBBP1A-213ENST00000575662 687 ntTSL 212.73□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 36.6
DDX6P26196 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.554e-6■■■■■ 36.6
DDX6P26196 CCDC12-203ENST00000446836 412 ntTSL 311.5□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 36.6
Retrieved 100 of 14,483 protein–RNA pairs in 139.3 ms