RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504236.1

ANKRD13D-204, Transcript of ankyrin repeat domain 13D, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD13D, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13D-204ENST00000504236 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.15■■■■■ 4.34
ANKRD13D-204ENST00000504236 ABCC9O60706 1549 aa37.82■■■■□ 3.64
ANKRD13D-204ENST00000504236 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.44■■■■□ 3.58
ANKRD13D-204ENST00000504236 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.32■■■■□ 3.4
ANKRD13D-204ENST00000504236 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.56■■■■□ 3.28
ANKRD13D-204ENST00000504236 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
ANKRD13D-204ENST00000504236 NACADO15069 1562 aa35.12■■■■□ 3.21
ANKRD13D-204ENST00000504236 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.08■■■■□ 3.212e-9■■■■□ 20.5
ANKRD13D-204ENST00000504236 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.99■■■■□ 3.19
ANKRD13D-204ENST00000504236 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.98■■■■□ 3.19
ANKRD13D-204ENST00000504236 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.93■■■■□ 3.18
ANKRD13D-204ENST00000504236 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.82■■■■□ 3.16
ANKRD13D-204ENST00000504236 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.65■■■■□ 3.14
ANKRD13D-204ENST00000504236 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.14■■■■□ 3.06
ANKRD13D-204ENST00000504236 SCRIBQ14160 1630 aa34.11■■■■□ 3.05
ANKRD13D-204ENST00000504236 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.11■■■■□ 3.05
ANKRD13D-204ENST00000504236 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34■■■■□ 3.03
ANKRD13D-204ENST00000504236 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.91■■■■□ 3.02
ANKRD13D-204ENST00000504236 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
ANKRD13D-204ENST00000504236 CUX2O14529 1486 aa32.91■■■□□ 2.86
ANKRD13D-204ENST00000504236 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
ANKRD13D-204ENST00000504236 SMARCA4P51532 1647 aa32.67■■■□□ 2.82
ANKRD13D-204ENST00000504236 ERCC6Q03468 1493 aa32.65■■■□□ 2.82
ANKRD13D-204ENST00000504236 NCAPD3P42695 1498 aa32.48■■■□□ 2.79
ANKRD13D-204ENST00000504236 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.46■■■□□ 2.79
ANKRD13D-204ENST00000504236 SMARCA2P51531 1590 aa32.41■■■□□ 2.78
ANKRD13D-204ENST00000504236 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.39■■■□□ 2.78
ANKRD13D-204ENST00000504236 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.36■■■□□ 2.77
ANKRD13D-204ENST00000504236 HMGXB3Q12766 1538 aa32.26■■■□□ 2.76
ANKRD13D-204ENST00000504236 NESP48681 1621 aa32.26■■■□□ 2.76
ANKRD13D-204ENST00000504236 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
ANKRD13D-204ENST00000504236 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
ANKRD13D-204ENST00000504236 WIZO95785 1651 aa32.14■■■□□ 2.74
ANKRD13D-204ENST00000504236 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
ANKRD13D-204ENST00000504236 TRIM41Q8WV44 630 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD13D-204ENST00000504236 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
ANKRD13D-204ENST00000504236 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.84■■■□□ 2.69
ANKRD13D-204ENST00000504236 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.8■■■□□ 2.68
ANKRD13D-204ENST00000504236 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.66■■■□□ 2.66
ANKRD13D-204ENST00000504236 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
ANKRD13D-204ENST00000504236 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.47■■■□□ 2.63
ANKRD13D-204ENST00000504236 WDR62O43379 1518 aa31.44■■■□□ 2.62
ANKRD13D-204ENST00000504236 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.43■■■□□ 2.62
ANKRD13D-204ENST00000504236 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.42■■■□□ 2.62
ANKRD13D-204ENST00000504236 CFTRP13569 1480 aa31.28■■■□□ 2.6
ANKRD13D-204ENST00000504236 OSCARQ8IYS5 282 aa31.26■■■□□ 2.59
ANKRD13D-204ENST00000504236 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.16■■■□□ 2.58
ANKRD13D-204ENST00000504236 PRDM2Q13029 1718 aa31.16■■■□□ 2.58
ANKRD13D-204ENST00000504236 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.07■■■□□ 2.56
ANKRD13D-204ENST00000504236 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.98■■■□□ 2.55
ANKRD13D-204ENST00000504236 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.98■■■□□ 2.55
ANKRD13D-204ENST00000504236 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.98■■■□□ 2.55
ANKRD13D-204ENST00000504236 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
ANKRD13D-204ENST00000504236 ARHGEF11O15085 1522 aa30.79■■■□□ 2.52
ANKRD13D-204ENST00000504236 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
ANKRD13D-204ENST00000504236 ABCC8Q09428 1581 aa30.64■■■□□ 2.5
ANKRD13D-204ENST00000504236 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.62■■■□□ 2.49
ANKRD13D-204ENST00000504236 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.61■■■□□ 2.49
ANKRD13D-204ENST00000504236 TOPBP1Q92547 1522 aa30.59■■■□□ 2.49
ANKRD13D-204ENST00000504236 IFT140Q96RY7 1462 aa30.57■■■□□ 2.48
ANKRD13D-204ENST00000504236 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
ANKRD13D-204ENST00000504236 ARAP1Q96P48 1450 aa30.45■■■□□ 2.47
ANKRD13D-204ENST00000504236 CUX1P39880 1505 aa30.45■■■□□ 2.47
ANKRD13D-204ENST00000504236 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
ANKRD13D-204ENST00000504236 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.36■■■□□ 2.45
ANKRD13D-204ENST00000504236 CHD1O14646 1710 aa30.36■■■□□ 2.45
ANKRD13D-204ENST00000504236 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
ANKRD13D-204ENST00000504236 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.32■■■□□ 2.44
ANKRD13D-204ENST00000504236 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.31■■■□□ 2.44
ANKRD13D-204ENST00000504236 TOP2BQ02880 1626 aa30.29■■■□□ 2.44
ANKRD13D-204ENST00000504236 SYNJ1O43426 1573 aa30.28■■■□□ 2.44
ANKRD13D-204ENST00000504236 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.445e-6■■■□□ 16.9
ANKRD13D-204ENST00000504236 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
ANKRD13D-204ENST00000504236 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
ANKRD13D-204ENST00000504236 SOGA1O94964 1423 aa30.2■■■□□ 2.42
ANKRD13D-204ENST00000504236 FBLN2P98095 1184 aa30.19■■■□□ 2.42
ANKRD13D-204ENST00000504236 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.17■■■□□ 2.42
ANKRD13D-204ENST00000504236 WDR97A6NE52 1622 aa30.11■■■□□ 2.41
ANKRD13D-204ENST00000504236 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.05■■■□□ 2.4
ANKRD13D-204ENST00000504236 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.01■■■□□ 2.39
ANKRD13D-204ENST00000504236 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ANKRD13D-204ENST00000504236 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKRD13D-204ENST00000504236 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.91■■■□□ 2.38
ANKRD13D-204ENST00000504236 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD13D-204ENST00000504236 GRIN2BQ13224 1484 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD13D-204ENST00000504236 PBRM1Q86U86 1689 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD13D-204ENST00000504236 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
ANKRD13D-204ENST00000504236 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
ANKRD13D-204ENST00000504236 KIF27Q86VH2 1401 aa29.71■■■□□ 2.35
ANKRD13D-204ENST00000504236 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.71■■■□□ 2.35
ANKRD13D-204ENST00000504236 SYNJ2O15056 1496 aa29.7■■■□□ 2.35
ANKRD13D-204ENST00000504236 ADAMTS12P58397 1594 aa29.63■■■□□ 2.33
ANKRD13D-204ENST00000504236 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.56■■■□□ 2.32
ANKRD13D-204ENST00000504236 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.55■■■□□ 2.32
ANKRD13D-204ENST00000504236 CUL7Q14999 1698 aa29.53■■■□□ 2.32
ANKRD13D-204ENST00000504236 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.52■■■□□ 2.32
ANKRD13D-204ENST00000504236 IGF1RP08069 1367 aa29.5■■■□□ 2.31
ANKRD13D-204ENST00000504236 GRIN2AQ12879 1464 aa29.47■■■□□ 2.31
ANKRD13D-204ENST00000504236 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.45■■■□□ 2.31
ANKRD13D-204ENST00000504236 EEA1Q15075 1411 aa29.37■■■□□ 2.29
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