Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA3P26006 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA3P26006 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms