Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
POLR2AP24928 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms