Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRM1P23921 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRM1P23921 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRM1P23921 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRM1P23921 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRM1P23921 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRM1P23921 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRM1P23921 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRM1P23921 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRM1P23921 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRM1P23921 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRM1P23921 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRM1P23921 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRM1P23921 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRM1P23921 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRM1P23921 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRM1P23921 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRM1P23921 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RRM1P23921 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRM1P23921 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRM1P23921 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRM1P23921 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRM1P23921 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRM1P23921 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRM1P23921 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRM1P23921 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRM1P23921 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRM1P23921 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRM1P23921 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRM1P23921 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRM1P23921 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RRM1P23921 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRM1P23921 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRM1P23921 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRM1P23921 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRM1P23921 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRM1P23921 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRM1P23921 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRM1P23921 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRM1P23921 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRM1P23921 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRM1P23921 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRM1P23921 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRM1P23921 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRM1P23921 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRM1P23921 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRM1P23921 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRM1P23921 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRM1P23921 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRM1P23921 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRM1P23921 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRM1P23921 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRM1P23921 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRM1P23921 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRM1P23921 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRM1P23921 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRM1P23921 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRM1P23921 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRM1P23921 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRM1P23921 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRM1P23921 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRM1P23921 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRM1P23921 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRM1P23921 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRM1P23921 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRM1P23921 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRM1P23921 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRM1P23921 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRM1P23921 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms