Protein–RNA interactions for Protein: P23610

F8A1, Factor VIII intron 22 protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8A1P23610 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8A1P23610 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8A1P23610 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8A1P23610 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8A1P23610 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8A1P23610 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8A1P23610 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8A1P23610 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8A1P23610 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8A1P23610 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8A1P23610 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8A1P23610 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8A1P23610 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F8A1P23610 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
F8A1P23610 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8A1P23610 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8A1P23610 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8A1P23610 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8A1P23610 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8A1P23610 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8A1P23610 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8A1P23610 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8A1P23610 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8A1P23610 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8A1P23610 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8A1P23610 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8A1P23610 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8A1P23610 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8A1P23610 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8A1P23610 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8A1P23610 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8A1P23610 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8A1P23610 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8A1P23610 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8A1P23610 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8A1P23610 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
F8A1P23610 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8A1P23610 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8A1P23610 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8A1P23610 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F8A1P23610 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F8A1P23610 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F8A1P23610 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F8A1P23610 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8A1P23610 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8A1P23610 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8A1P23610 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8A1P23610 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8A1P23610 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8A1P23610 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8A1P23610 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8A1P23610 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8A1P23610 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8A1P23610 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
F8A1P23610 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8A1P23610 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8A1P23610 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8A1P23610 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8A1P23610 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8A1P23610 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8A1P23610 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8A1P23610 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8A1P23610 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8A1P23610 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
F8A1P23610 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8A1P23610 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8A1P23610 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8A1P23610 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
F8A1P23610 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8A1P23610 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8A1P23610 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8A1P23610 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8A1P23610 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8A1P23610 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8A1P23610 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8A1P23610 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8A1P23610 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8A1P23610 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8A1P23610 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8A1P23610 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8A1P23610 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8A1P23610 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
F8A1P23610 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8A1P23610 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8A1P23610 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8A1P23610 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8A1P23610 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8A1P23610 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8A1P23610 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8A1P23610 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8A1P23610 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8A1P23610 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
F8A1P23610 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8A1P23610 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8A1P23610 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8A1P23610 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8A1P23610 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8A1P23610 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
F8A1P23610 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
F8A1P23610 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms