Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFSF4P23510 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFSF4P23510 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms