Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRGP23470 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PTPRGP23470 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PTPRGP23470 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRGP23470 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms