Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD9P21926 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD9P21926 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD9P21926 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD9P21926 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD9P21926 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD9P21926 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD9P21926 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD9P21926 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD9P21926 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD9P21926 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD9P21926 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD9P21926 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD9P21926 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD9P21926 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD9P21926 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD9P21926 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD9P21926 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD9P21926 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD9P21926 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD9P21926 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD9P21926 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD9P21926 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD9P21926 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD9P21926 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD9P21926 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD9P21926 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD9P21926 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD9P21926 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD9P21926 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD9P21926 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD9P21926 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD9P21926 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD9P21926 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD9P21926 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CD9P21926 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CD9P21926 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD9P21926 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD9P21926 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD9P21926 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD9P21926 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD9P21926 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD9P21926 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD9P21926 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD9P21926 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD9P21926 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms