Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA5P20719 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms