Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMNB1P20700 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LMNB1P20700 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMNB1P20700 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms