Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGCP20142 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGCP20142 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGCP20142 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGCP20142 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGCP20142 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGCP20142 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGCP20142 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGCP20142 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGCP20142 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGCP20142 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGCP20142 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGCP20142 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PGCP20142 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGCP20142 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGCP20142 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGCP20142 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGCP20142 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGCP20142 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGCP20142 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGCP20142 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGCP20142 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGCP20142 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGCP20142 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGCP20142 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGCP20142 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGCP20142 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGCP20142 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGCP20142 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGCP20142 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGCP20142 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGCP20142 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGCP20142 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGCP20142 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGCP20142 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGCP20142 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGCP20142 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGCP20142 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGCP20142 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGCP20142 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGCP20142 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGCP20142 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGCP20142 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGCP20142 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGCP20142 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PGCP20142 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms