Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCN2P20062 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCN2P20062 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCN2P20062 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCN2P20062 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCN2P20062 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCN2P20062 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN2P20062 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN2P20062 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN2P20062 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN2P20062 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN2P20062 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN2P20062 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN2P20062 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN2P20062 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCN2P20062 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN2P20062 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN2P20062 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN2P20062 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN2P20062 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN2P20062 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN2P20062 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN2P20062 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN2P20062 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCN2P20062 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN2P20062 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN2P20062 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN2P20062 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN2P20062 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCN2P20062 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN2P20062 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN2P20062 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN2P20062 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN2P20062 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN2P20062 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN2P20062 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN2P20062 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCN2P20062 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCN2P20062 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN2P20062 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN2P20062 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN2P20062 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN2P20062 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN2P20062 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCN2P20062 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCN2P20062 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCN2P20062 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCN2P20062 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN2P20062 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN2P20062 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN2P20062 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN2P20062 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN2P20062 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN2P20062 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN2P20062 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN2P20062 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCN2P20062 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCN2P20062 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN2P20062 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN2P20062 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN2P20062 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN2P20062 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN2P20062 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN2P20062 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCN2P20062 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN2P20062 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN2P20062 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN2P20062 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCN2P20062 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN2P20062 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN2P20062 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN2P20062 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN2P20062 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN2P20062 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN2P20062 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCN2P20062 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN2P20062 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN2P20062 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCN2P20062 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms