Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-DPA1P20036 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DPA1P20036 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms