Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMY2BP19961 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AMY2BP19961 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms