Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM21P19474 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM21P19474 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms