Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCLP19338 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCLP19338 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCLP19338 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCLP19338 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCLP19338 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCLP19338 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCLP19338 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCLP19338 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCLP19338 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCLP19338 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCLP19338 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCLP19338 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCLP19338 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCLP19338 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NCLP19338 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCLP19338 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NCLP19338 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NCLP19338 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NCLP19338 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NCLP19338 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCLP19338 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCLP19338 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCLP19338 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NCLP19338 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NCLP19338 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCLP19338 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCLP19338 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NCLP19338 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCLP19338 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCLP19338 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NCLP19338 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCLP19338 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCLP19338 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCLP19338 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCLP19338 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCLP19338 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCLP19338 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NCLP19338 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCLP19338 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCLP19338 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCLP19338 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCLP19338 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NCLP19338 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCLP19338 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCLP19338 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCLP19338 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCLP19338 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCLP19338 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCLP19338 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCLP19338 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCLP19338 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCLP19338 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCLP19338 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCLP19338 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCLP19338 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NCLP19338 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCLP19338 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCLP19338 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCLP19338 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCLP19338 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCLP19338 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCLP19338 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCLP19338 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCLP19338 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCLP19338 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NCLP19338 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCLP19338 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCLP19338 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCLP19338 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCLP19338 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCLP19338 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCLP19338 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCLP19338 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCLP19338 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCLP19338 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCLP19338 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms