Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VCAM1P19320 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCAM1P19320 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms