Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEBPBP17676 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEBPBP17676 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEBPBP17676 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEBPBP17676 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms