Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB9P17482 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB9P17482 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms