Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTLA4P16410 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTLA4P16410 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms