Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAG1P15918 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAG1P15918 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAG1P15918 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG1P15918 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG1P15918 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG1P15918 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG1P15918 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG1P15918 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG1P15918 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG1P15918 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG1P15918 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG1P15918 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG1P15918 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAG1P15918 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAG1P15918 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAG1P15918 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAG1P15918 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAG1P15918 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAG1P15918 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAG1P15918 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAG1P15918 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAG1P15918 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAG1P15918 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAG1P15918 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAG1P15918 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAG1P15918 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAG1P15918 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAG1P15918 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAG1P15918 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAG1P15918 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAG1P15918 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAG1P15918 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAG1P15918 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAG1P15918 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAG1P15918 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAG1P15918 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAG1P15918 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAG1P15918 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAG1P15918 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAG1P15918 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAG1P15918 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAG1P15918 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAG1P15918 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAG1P15918 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAG1P15918 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAG1P15918 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAG1P15918 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAG1P15918 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAG1P15918 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAG1P15918 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAG1P15918 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAG1P15918 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAG1P15918 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAG1P15918 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAG1P15918 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAG1P15918 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAG1P15918 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAG1P15918 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAG1P15918 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAG1P15918 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAG1P15918 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAG1P15918 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAG1P15918 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAG1P15918 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAG1P15918 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAG1P15918 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAG1P15918 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAG1P15918 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAG1P15918 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAG1P15918 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAG1P15918 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAG1P15918 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAG1P15918 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAG1P15918 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAG1P15918 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAG1P15918 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RAG1P15918 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAG1P15918 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAG1P15918 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAG1P15918 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAG1P15918 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RAG1P15918 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAG1P15918 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAG1P15918 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAG1P15918 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAG1P15918 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAG1P15918 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAG1P15918 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAG1P15918 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAG1P15918 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAG1P15918 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAG1P15918 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAG1P15918 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAG1P15918 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAG1P15918 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAG1P15918 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAG1P15918 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAG1P15918 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAG1P15918 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms