Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG2P13727 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG2P13727 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG2P13727 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG2P13727 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG2P13727 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG2P13727 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG2P13727 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG2P13727 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRG2P13727 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRG2P13727 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG2P13727 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG2P13727 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG2P13727 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRG2P13727 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG2P13727 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRG2P13727 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRG2P13727 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRG2P13727 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRG2P13727 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRG2P13727 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRG2P13727 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRG2P13727 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRG2P13727 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRG2P13727 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRG2P13727 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRG2P13727 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRG2P13727 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRG2P13727 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRG2P13727 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRG2P13727 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRG2P13727 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRG2P13727 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRG2P13727 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRG2P13727 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRG2P13727 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRG2P13727 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRG2P13727 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRG2P13727 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRG2P13727 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRG2P13727 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms