Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT13P13646 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT13P13646 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT13P13646 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT13P13646 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT13P13646 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT13P13646 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT13P13646 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT13P13646 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT13P13646 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT13P13646 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT13P13646 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT13P13646 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT13P13646 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT13P13646 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT13P13646 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT13P13646 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT13P13646 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT13P13646 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT13P13646 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT13P13646 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT13P13646 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT13P13646 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT13P13646 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT13P13646 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT13P13646 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT13P13646 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT13P13646 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT13P13646 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT13P13646 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT13P13646 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT13P13646 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT13P13646 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT13P13646 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT13P13646 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT13P13646 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT13P13646 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT13P13646 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT13P13646 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT13P13646 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT13P13646 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT13P13646 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT13P13646 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT13P13646 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT13P13646 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT13P13646 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT13P13646 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT13P13646 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT13P13646 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT13P13646 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT13P13646 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT13P13646 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT13P13646 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT13P13646 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT13P13646 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT13P13646 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT13P13646 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT13P13646 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT13P13646 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT13P13646 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT13P13646 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms