Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP4P12644 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP4P12644 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP4P12644 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP4P12644 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP4P12644 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP4P12644 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP4P12644 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP4P12644 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP4P12644 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BMP4P12644 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP4P12644 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP4P12644 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP4P12644 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP4P12644 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP4P12644 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP4P12644 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP4P12644 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BMP4P12644 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BMP4P12644 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP4P12644 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP4P12644 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BMP4P12644 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BMP4P12644 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP4P12644 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BMP4P12644 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BMP4P12644 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP4P12644 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP4P12644 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP4P12644 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP4P12644 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP4P12644 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP4P12644 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP4P12644 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP4P12644 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BMP4P12644 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP4P12644 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP4P12644 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP4P12644 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BMP4P12644 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP4P12644 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP4P12644 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP4P12644 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP4P12644 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP4P12644 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP4P12644 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP4P12644 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP4P12644 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP4P12644 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BMP4P12644 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP4P12644 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP4P12644 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP4P12644 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP4P12644 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP4P12644 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP4P12644 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP4P12644 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BMP4P12644 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms