Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
TOP2AP11388 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOP2AP11388 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOP2AP11388 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC41.73■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
TOP2AP11388 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
TOP2AP11388 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms