Protein–RNA interactions for Protein: P10643

C7, Complement component C7, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7P10643 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C7P10643 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C7P10643 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C7P10643 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C7P10643 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C7P10643 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C7P10643 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C7P10643 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C7P10643 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C7P10643 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C7P10643 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C7P10643 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C7P10643 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C7P10643 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C7P10643 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C7P10643 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C7P10643 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C7P10643 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C7P10643 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C7P10643 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C7P10643 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C7P10643 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C7P10643 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C7P10643 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C7P10643 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C7P10643 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C7P10643 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C7P10643 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C7P10643 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C7P10643 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C7P10643 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C7P10643 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C7P10643 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C7P10643 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C7P10643 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C7P10643 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C7P10643 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C7P10643 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C7P10643 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C7P10643 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C7P10643 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C7P10643 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C7P10643 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C7P10643 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C7P10643 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C7P10643 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C7P10643 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C7P10643 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C7P10643 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C7P10643 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C7P10643 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C7P10643 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C7P10643 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C7P10643 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C7P10643 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C7P10643 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C7P10643 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C7P10643 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C7P10643 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C7P10643 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C7P10643 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C7P10643 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C7P10643 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C7P10643 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C7P10643 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C7P10643 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C7P10643 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C7P10643 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C7P10643 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C7P10643 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C7P10643 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C7P10643 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C7P10643 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C7P10643 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C7P10643 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C7P10643 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C7P10643 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C7P10643 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C7P10643 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C7P10643 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C7P10643 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C7P10643 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C7P10643 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C7P10643 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C7P10643 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C7P10643 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C7P10643 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C7P10643 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C7P10643 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C7P10643 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms