Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI4P10075 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI4P10075 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI4P10075 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI4P10075 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI4P10075 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI4P10075 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GLI4P10075 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLI4P10075 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLI4P10075 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLI4P10075 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLI4P10075 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLI4P10075 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLI4P10075 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLI4P10075 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLI4P10075 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GLI4P10075 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GLI4P10075 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GLI4P10075 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GLI4P10075 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GLI4P10075 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GLI4P10075 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLI4P10075 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLI4P10075 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLI4P10075 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLI4P10075 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLI4P10075 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLI4P10075 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLI4P10075 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GLI4P10075 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GLI4P10075 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GLI4P10075 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GLI4P10075 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GLI4P10075 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GLI4P10075 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GLI4P10075 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GLI4P10075 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GLI4P10075 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GLI4P10075 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GLI4P10075 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GLI4P10075 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GLI4P10075 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GLI4P10075 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GLI4P10075 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GLI4P10075 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GLI4P10075 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GLI4P10075 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLI4P10075 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLI4P10075 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLI4P10075 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLI4P10075 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GLI4P10075 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GLI4P10075 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLI4P10075 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLI4P10075 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLI4P10075 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLI4P10075 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLI4P10075 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GLI4P10075 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLI4P10075 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLI4P10075 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLI4P10075 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GLI4P10075 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLI4P10075 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLI4P10075 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLI4P10075 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GLI4P10075 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GLI4P10075 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GLI4P10075 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLI4P10075 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLI4P10075 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLI4P10075 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLI4P10075 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLI4P10075 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLI4P10075 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GLI4P10075 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLI4P10075 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLI4P10075 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GLI4P10075 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLI4P10075 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLI4P10075 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLI4P10075 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLI4P10075 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLI4P10075 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLI4P10075 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLI4P10075 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLI4P10075 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLI4P10075 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GLI4P10075 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms